農藝學系榮譽獎項：
1.學生優秀表現事蹟：
（1）99年度第一屆大專青年NPO創新服務學習『漾青春，部落格』徵選競賽，本系學生獲得亞軍獎。
（2）2008全國大專院校學生創業與創意競賽活動，本系學生以「美濃客家庄生態教育農園改善企劃案」獲得第一名。
(3)本系四年級林亭君同學於103年10月4日~5日參加2014年第一屆全國製茶技術競賽，榮獲學生組冠軍。
(4) 本系系學會代表中興大學參加由嘉義大學舉辦的「103年全國大專社團評鑑」榮獲「自治性、綜合性」優等獎。
(5)國立中興大學農藝系系學會(社團) 於105年3月20日，榮獲教育 105年全國大專院校學生社團評選暨觀摩活動(大學院校組自治性、綜合性)甲等獎。
2.農藝系傑出研究成果：
本系成立九十年來，培養眾多農業研究及政務人才，為台灣農業建設之主力，台灣重要的農藝作物品種，絕大部分是由本系畢業系友育成。全世界第一個半矮性水稻、台灣栽植面積最廣的台農67號稻米、台稉9號稻米、益全香米等均由本系系友研發。
3.傑出系友：
1.61年本系系友凃勳博士獲得十大傑出青年及全國最優公務人員。
2.72年本系系友凃勳博士獲得全國最優公務人員。
3.79年本系系友李成章博士榮任農學院院長，並擔任亞洲農業大學及農學院校學會（AAACU）會長。
4.80年本系李成章教授榮任UC Davis 傑出校友。
5.81年本系李成章教授榮任中華農藝學會理事長。
6.84年本系李成章教授榮任亞洲地區作物學會會長。
7.84年本系系友洪梅珠博士獲得十大農業傑出專家。
8.84年本系系友許志聖博士獲得十大傑出青年。
9.86年本系系友楊純明博士獲得十大傑出青年。
10.86年李成章教授接任本校校長。
11.91年本系李成章教授榮獲本校傑出校友、榮譽教授及本系傑出系友。
12.93年本系系友洪梅珠博士獲得第三屆農福「金禾獎」及台灣之子「國家農藝科技獎」。
13.93年陳世雄教授接任本校總務長。
14.93年本系系友謝順景博士獲得第一屆總統頒發「農業和平獎」。
15.94年江益男系友榮獲本校傑出校友（農藝系55年畢業）。
16.95年凃勳榮獲本校傑出校友（農藝系47年畢業）。
17.95年蔡新聲榮獲本校傑出校友（農藝系57年畢業）。
18.97年本系系友陳文德榮任農業委員會農糧署署長。
19.97年本系系友陳進利獲得立法院通過榮任監察院副院長。
20.99年9月陳世雄教授接任明道大學校長。
21.100年6月本系系友李蒼朗榮任農業委員會農糧署署長。
22.104年陳世雄榮獲本校傑出校友（農藝系學士碩士班畢業）。
23.104年李蒼朗榮獲本校傑出校友（農藝系碩士班畢業）。