系所成員

經歷 / 榮譽

94年專門及職業技術人員高等考試技師考試-農藝技師 及格
95年公務人員高等考試二級考試-農業技術 錄取
行政院農業委員會畜產試驗所新竹分所 助理研究員 (2007年-2008年)
中華民國駐史瓦濟蘭王國技術團 農藝助理技師 (2008年-2009年)
USDA-ARS Dale Bumpers National Rice Research Center- Visiting Scholar (2016)
行政院農業委員會農業試驗所作物組 助理研究員 (2009年-2019年)
國立中興大學農藝學系兼任助理教授 [開授：作物育種方法] (2019年-2021年)
行政院農業委員會農業試驗所作物組 副研究員 (2019年-2023年7月)
農業部農業試驗所作物組 副研究員 (2023年8月-2025年7月)
[榮耀]
102年度臺灣農藝學會青年學術成就獎，102年4月，臺灣農藝學會
106年度臺灣農藝學會個人事業獎，106年4月，臺灣農藝學會
2017未來突破獎-強健、少用水、高產量的益全香米-團隊成員，106年11月 科技部
2018年「總統盃社會創新黑客松」十大決選團隊-主辦人，107年7月，總統府
2019年國家農業科學獎-群策群力獎 108年12月，行政院農業委員會
109年度農學會優秀農業基層人員獎 109年12月，台灣農學會
111年度中華民國雜草學會優秀農業基層人員獎，111年12月，中華民國雜草學會
113年度臺灣農藝學會學術成就獎，113年4月，臺灣農藝學會
114年薦任公務人員晉升簡任官等訓練及格

學術著作

(A) 期刊論文:
1. Hsu, Y.-T., Wang, Y.-C., Du, P.-R., Li, C.-P., & Dong–Hong Wu*. (2025). Morphological Diversity and Crop Mimicry Strategies of Weedy Rice Under the Transplanting
Cultivation System. Agronomy, 15(4), 984.
2. Ke-Sheng Cheng, Gwo-Hsing Yu, Yuan-Li Tai, Kuo-Chan Huang, Sheng-Fu Tsai, Dong-Hong Wu, Yun-Ching Lin, Ching-Teng Lee, Tzu-Ting Lo. 2024. Hypothesis testing for performance evaluation of probabilistic seasonal rainfall forecasts. Geoscience Letters. 11:27. [IF:4.375]
3. SY Chen, MH Lai, YL Chu, DH Wu, CW Tung, YJ Chen, CL Chung. 2023. Identification of qBK2. 1, a novel QTL controlling rice resistance against Fusarium fujikuroi. Botanical Studies 64 (1), 1-10.
4. Yi-Nian Chen, Dong-Hong Wu*, Mei-Chun Chen, Meng-Ting Hsieh, Woei-Shyuan Jwo, Guo-Cih Lin, Rong-Kuen Chen, Hau-Ping Chou, Pei-Chen Chen*. 2023. Dynamics of spatial and temporal population structure of Pyricularia oryzae in Taiwan. Pest Management Science. 79: 4254–4263. DOI: 10.1002/ps.7621
5. Sheng-Fu Tsai, Dong-Hong Wu, Gwo-Hsing Yu, Ke-Sheng Cheng. 2023. Risk-based irrigation decision-making for the Shihmen Reservoir Irrigation District of Taiwan. Paddy and Water Environment. 21: 497–508. DOI: 10.1007/s10333-023-00943-9
6. Chia-Hua Hsu, Fang-Yi Cheng, Chi-Ling Chen, Dong-Hong Wu, Tzu-Ying Chen, Kuo-Fu Liao, Wen-Lung Lay, Yi-Ting Zhang. 2023. A high-resolution inventory of ammonia emissions from agricultural fertilizer application and crop residue in Taiwan. Atmospheric Environment. 309: 119920. DOI: 10.1016/j.atmosenv.2023.119920
7. Charng-Pei Li*, Dong-Hong Wu*, Shou-Horng Huang, Menghsiao Meng, Hsien-Tzung Shih, Ming-Hsin Lai, Liang-Jwu Chen, Kshirod K. Jena, Sherry Lou Hechanova, Ting-Jyun Ke, Tai-Yuan Chiu, Zong-Yuan Tsai, Guo-Kai Chen, Kuan-Chieh Tsai and Wei-Ming Leu. 2023. The Bph45 Gene Confers Resistance against Brown Planthopper in Rice by Reducing the Production of Limonene. Int. J. Mol. Sci. 24:1798. [IF: 6.208]
8. Chien-Hui Syu, Ting-Iun Nieh, Meng-Ting Hsieh, Yu-Ching Lo, Pei-Rong Du, Yu-Wen Lin and Dong-Hong Wu*. 2022. Uncovering the genetics of cadmium accumulation in the rice 3K panel. Plants-basel, 11(21): 2813. https://doi.org/10.3390/plants11212813. [IF: 4.658]
9. Dong-Hong Wu, Chung-Tse Chen, Ming-Der Yang, Yi-Chien Wu, Chia-Yu Lin, Ming-Hsin Lai and Chin-Ying Yang. 2022. Controlling the Lodging Risk of Rice Based on a Plant Height Dynamic Model. Botanical Studies, 63:25.
10. 林家玉、吳東鴻、吳以健、楊靜瑩、楊明德、賴明信、張素貞，2022，不同氮肥施用量對節水栽培水稻臺南11號產量之影響，苗栗區農業改良場研究彙報 11:67-78.
11. Wei-Chun Hsu, Dong-Hong Wu*, Szu-Wu Chen, Sergio Antonio Cuadra Castillo, Sih-Dun Huang, Charng-Pei Li, Yun-Ping Wang. 2022. Insights into the Genetic Spatial Structure of Nicaragua Weedy Rice and Control of Its Seed Spread. Pest Manag Sci 78: 3685–3696. [IF: 4.87]
12. Hsin-Hung Tseng, Ming-Der Yang*, R. Saminathan Yu-Chun Hsu, Chin-Ying Yang, and Dong-Hong Wu. 2022. Rice Seedlings Detection in UAV Images using Transfer Learning and Machine Learning. Remote Sens. 14, 2837. doi.org/10.3390/rs14122837. [IF: 4.509]
13. Ming-Der Yang, Yu-Chun Hsu, Wei-Cheng Tseng, Chian-Yu Lu, Chin-Ying Yang, Ming-Hsin Lai, and Dong-Hong Wu. 2021. Assessment of Grain Harvest Moisture Content Using Machine Learning on Smart Phone Images for Optimal Harvest Timing. Sensors, 21(17):5875. [IF: 3.275]
14. Guan Sin Li, Dong Hong Wu, Yuan Chih Su, Bo Jein Kuo, Ming Der Yang, Ming Hsin Lai, Hsiu Ying Lu and Chin Ying Yang. 2021. Prediction of plant nutrition state of rice under water saving cultivation and earing fertilization application decision making. Agronomy. 11:1626. [IF: 3.417]
15. Ming-Der Yang, Hsin-Hung Tseng*, Yu-Chun Hsu, Chin-Ying Yang, Ming-Hsin Lai and Dong-Hong Wu. 2021. A UAV Open Dataset of Rice Paddies for Deep Learning Practice. Remote Sens., 13, 1358. doi:10.3390/rs13071358 [IF: 4.509]
16. Yu-Lan Lin, Dong-Hong Wu, Chen-Chieh Wu, Yung-Fen Huang. 2021. Explore Weedy Trait Genetics Using Rice 3K Database. Botanical Studies, 62:2 DOI: 10.1186/s40529-020-00309-y. [IF: 2.163]
17. Chin-Ying Yang, Ming-Der Yang*, Wei-Cheng Tseng, Yu-Chun Hsu, Guan-Sin Li, Ming-Hsin Lai, Dong-Hong Wu and Hsiu-Ying Lu. 2020. Assessment of rice developmental stage using time series UAV imagery for variable irrigation management. Sensors, 20:5354; doi:10.3390/s20185354. [IF: 3.275]
18. Yi-Nian Chen, Dong-Hong Wu, Mei-Chun Chen, Pei-Chen Chen*. 2021. A simple and economic method to induce sporulation of Pyricularia oryzae. J. Taiwan Agric. Res., 70(1):1-10.
19. Yung-Fen Huang , Dong-Hong Wu* , Chih-Lu Wang , Pei-Rong Du, Chih-Yun Cheng , Chia-Chi Cheng. 2021. Survey of rice production practices and perception of weedy red rice (Oryza sativa f. spontanea) in Taiwan. Weed Sci. 69(5):526-535. 10.1017/wsc.2020.73. [Invited articles, IF: 2.258]
20. Chieh-Yi Chen, Szu-Yu Chen, Chun-Wei Liu, Dong-Hong Wu, Chien-Chih Kuo, Chun-Chi Lin, Hau-Ping Chou, Yu-Yao Wang, Yi-Chen Tsai, Ming-Hsin Lai, Chia-Lin Chung*. 2020. Invasion and colonization pattern of Fusarium fujikuroi in rice. Phytopathology, 110:1934-1945. DOI: 10.1094/PHYTO-03-20-0068-R [IF: 3.264]
21. An-Po Cheng, Szu-Yu Chen, Ming-Hsin Lai, Dong-Hong Wu, Hsin-Hung Yeh, Shih-Shun Lin, Chieh-Yi Chen, Chia-Lin Chung*. 2020. Transcriptome analysis of early defenses in rice against Fusarium fujikuroi. Rice 13(1): 1-15. [IF: 3.513]
22. Edward Yun Cheng, Dong-Hong Wu, Zu-Hsien Wang, Yu-Bing Huang*, Ming-Yaw Chiang, Hsiu-Ying Lu, and Chung-Min Yang. 2020. Genetically Masked of Dorsocentral
Bristle Expression by a Single Dominant Gene DCm in Melon Fly, Zeugodacus cucurbitae (Coquilett). J. Taiwan Agric. Res. 69:113-121.
23. Dong-Hong Wu*, David R Gealy, Melissa H Jia, Jeremy D Edwards, Ming-Hsin Lai, Anna M McClung. 2020. Phylogenetic origin and dispersal pattern of Taiwan weedy rice. Pest Management Science. 76(5):1639-1651. https://doi.org/10.1002/ps.5683 [IF: 4.87]
24. Po-Jung Wang, Chia-Chi Cheng* and Dong-Hong Wu. 2019. Development of quality and starch hydrolysis-relating indexes database of domestic rice varieties. 
[ 初步建置國內水稻品種建置米質及澱粉特性相關指標資料平台] Res. Bull. Taichung DARES. 143:35-48.
25. Chien-Hui Syu, Chia-Yi Cheng, Tsang-Sen Liu, Dong-Hong Wu, Horng-Yuh Guo, and Yu-Wen Lin*. 2019. Effect of water management on the accumulation of cadmium in rice grain of different rice cultivars. [水分管理對不同水稻品種穀粒鎘累積之影響] J. Taiwan Agric. Res. 68(4):315-326.
26. Szu-Yu Chen, Ming-Hsin Lai, Chih-Wei Tung, Dong-Hong Wu, Fang-Yu Chang, Tsung-Chun Lin, and Chung, Chia-Lin*. 2019. Genome-wide association mapping of gene loci affecting disease resistance in the rice-Fusarium fujikuroi pathosystem. Rice. 12:1-12. https://doi.org/10.1186/s12284-019-0337-3 [IF: 3.513]
27. Chia-Hsun Ho, Dong-Hong Wu*, Chiao-Ling Hsiao, Chwen-Ming Yang, Hsin-Mu Yen. 2019. Effects of nitrogen fertilizer on photosynthetic characterization in japonica introgression lines with high sink-source traits. [氮肥對稉稻高供源與積存特性導入系之光合生理特徵影響] Crop Environ. Bioinform. 16:120-128.
28. Yu-Sian Wu, Yi-Ting Hsu, Chung-Tse Chen, Pei-Jhen Wu, Dong-Hong Wu, Ming-Hsin Lai, Bo-Jein Kuo, Chung-Li Chen, Chin-Ying Yang. 2019. Management of paddy field irrigation using intelligent water-level monitoring devices and examining corresponding changes in physiological characteristics and yield in rice. [透過田間智能水位感測管理水稻灌溉用水量及稻株生理性狀與產量變化探討] Crop Environ. Bioinform. 16:87-97.
29. Man-Hsia Yang, Dong-Hong Wu, Chen-Hung Kao*. 2019. A Statistical Procedure for Genome-wide Detection of QTL Hotspots Using Public Databases with Application to Rice. G3-Genes Genom Genet 9(2):439-452. DOI: 10.1534/g3.118.200922.
30. Cheng, Y. Edward, Z. H. Wang, Y. B. Huang, M. Y. Chiang, H. Y. Lu, D. H. Wu, C. M. Yang and C. C. Nien. 2018. Reduction in Genetic Variability for Quantitative Trait Prescutellar Bristle Number of Melon Fly [Bactrocera (Zeugodacus) cucurbitae (Coquillett)]. J. Taiwan Agric. Res. 67:337-346.
31.Dong-Hong Wu*, Charng-Pei Li and Yung-Fen Huang. 2018. Infestations and Control Strategies of Weedy Red Rice under transplanting model. [綜論文章，移植體系下雜草型紅米之危害、傳播與防治策略]，Weed Sci. Bulletin 39: 71-84.
32.Cheng, Y. Edward, Z. H. Wang, Y. B. Huang, M. Y. Chiang, H. Y. Lu, D. H. Wu, C. M. Yang and C. C. Nien. 2018. The genetic interaction on the quantitative traits of prescutellar bristles in melon fly, Bactrccera (Zeudodacus) cucurbitae (Coquillett). J. Taiwan Agric. Res. 67:9-15.
33.Liao, Dah-Jing, Pei-Chen Wu, and Dong-Hong Wu*. 2018. Study on development of indica breeding lines introgressed blast gene for Pia and Piz loci through marker–assisted backcross approach [針對稻熱病Pia及Piz基因座分子輔助選育秈稻新品系之研究]，J. Taiwan Agric. Res. 67:54-72.
34.Jwo, Woei-Shyuan, Chung-Li Chen, Charng-Pei Li, Ming-Hsin Lai, Dong-Hong Wu, and Hsing Mu Yen. 2017. Yield potential analysis of super hybrid rice grown in Taiwan [超級雜交稻在臺灣的產量潛力分析]，J. Taiwan Agric. Res. 66:343-355.
35.Wu, Dong-Hong, Chun-Shan Wang, and Kae-Kang Hwu. 2017. Simulation and Development Study of Whole Chromosome Substituted Lines on Rice [水稻全染色體置換系之族群模擬與選育研究]. Crop Environ. Bioinform. 14(3):141-152.
36.Cheng, Chih-Yun, Yi-Chien Wu, Bin-Gi Wu, Chang-Pei Li, David R. Gealy, and Dong-Hong Wu*. 2017. Morphological diversity study on Taiwan weedy red rice [台灣雜草型紅米之形態歧異度分析]. J. Agric. Assoc. Taiwan 18(2): 161-188.
37.Wu, Pi-Jen, Yu-Wen Lin, Charng-Pei Li, Chien-Hui Syu, Woei-Shyuan Jwo, Hsing-Mu Yen, Horng-Yuh Guo, Ming-Hsin Lai, and Dong-Hong Wu*. 2017. A novel indica rice breeding line selection with low cadmium accumulation level by functional markers assisted backcross strategy [以功能性分子標誌輔助回交策略選育具低鎘累積能力之秈稻新品系]. J. Taiwan Agric. Res. 66:248-260.
38.Liu, Li-Yu Daisy, Qiu-Yuan Chen, Zhi-Wei Yang, Chia-Chi Cheng, Bin-Gi Wu, Hsin-Yu Chang, Wen-Yen Ting, Chia-Hsing Huang, Hsiu-Ying Lu, Ming-Hsin Lai and Dong-Hong Wu*. 2016. Illustration of GGE Biplot Analysis on Rice Regional-Trial Dataset [水稻產量區域試驗之GGE分析法雙軸圖例釋]. Crop Environ. Bioinform. 13:167-178.
39.Chen, Szu-Yu; Kai-Jyun Huang, Yan-Fu Kuo, Ming-Hsin Lai, Dong-Hong Wu, and Chia-Lin Chung. 2016. Exploring gene loci controlling Bakanae disease resistance by genome-wide association mapping. Phytopathology 106(12S): 81-81。
40.Wang, Yu-Hua, Dong-Hong Wu, Jin-Hsing Huang, Shing-Jy Tsao, Kae-Kang Hwu, Hsiao-Feng Lo. 2016. Mapping Quantitative trait loci for fruit traits and powdery mildew resistance in melon. Botanical studies.57:19. doi: 10.1186/s40529-016-0130-1, Cited time: 1 time.
41.Lai, Ming–Hsing, Charng–Pei Li, Woei–Shyuan Jwo, Hsing–Mu Yen, Kae-Kang Hwu, and Dong–Hong Wu*. 2016. Study on development of japonica breeding lines introgressed high grain number gene through marker–assisted backcross approach [應用分子輔助回交選育稉稻多粒數品系之探討]，J. Taiwan Agric. Res. 65:31-44. doi: 10.6156/JTAR/2016.06501.04
42.Chia-Hsun Ho#, Dong-Hong Wu#, Chwen-Ming Yang*, Chiao-Ling Hsiao, and Ming-Hsin Lai. 2015，Studies on Yield Components of Rice High Yielding Potential Near-isogenic Lines and Improvement of Their Productivity [稉稻高產潛能近同源系產量特性及生產力提升之研究]. Crop Environ. Bioinform. 12: 166-182.
43.Lin, Yann-Rong, Hsiang-Ting Chien, Han-Shiuan Chin, Hung-Ying Lin, Hsing-Mu Yen, Woei-Shyuan Jwo, Dong-Hong Wu, Ming-Hsing Lai, Charng-Pei Li. 2015. The Development and Application of Molecular Markers of Wild Rice [野生稻DNA分子標幟之開發與應用]. J. Taiwan Agric. Res.. 64:253-278. doi: 10.6156/JTAR/2015.06404.02
44.Lin, Tzu-Che, Wei-Ting Liu, Kuo-Yi Huang, Jih-Min Sung, Charang-Pei Li, Dong-Hong Wu, and Ming-Hsin Lai. 2014. Study on changes of grain shape of rice cultivar ‘TNG67’ during filling stage by image analysis [台農67號榖粒充實過程動態影像變化之研究]. J. Taiwan Agric. Res. 63(2): 122–128. doi:10.6156/JTAR/2014.06302.03
45.Hsieh, Ming-Hsiu, Dong-Hong Wu, and Kai-Yi Chen. 2014. Mapping of QTLs controlling pre-harvest sprouting in the cross between japonica rice cultivars using RAD sequencing [使用限制酶位點標定之核酸定序法進行稉稻雜交組合之穗上發芽數量性狀基因座的遺傳定位]. Crop Environ. Bioinform. 11: 1-15.
(B) 研討會論文(Conference papers):
1. 林家玉、鄧執庸、吳以健、吳東鴻、陳純葳、朱盛祺、王強生、張素貞，2023，堆疊抗白葉枯病基因在水稻韌性生產上之策略，植物保護科技在韌性農業之應用研討會專刊，7-30頁，中華植物保護學會，國立中興大學，臺中，112年11月。
2. 賴明信、吳東鴻、林家玉、吳以建、姚美吉、許龍欣、呂秀英，2023，水稻智慧農業技術研發與應用，2023水稻藝術及米食文化論壇專刊，28-40頁，農業部苗栗區農業改良場，苗栗縣公館鄉，112年11月。
3. 吳東鴻、丁芝筠、謝孟婷、王芷露、杜沛蓉、鍾雅倫、張永彬、李長沛，2023，雜草稻自生苗對米質規格之影響與防除效益評估，稻米品質提升與水稻多元利用研討會論文輯，33-43頁，李誠紘、吳以健、鄧執庸、洪梅珠、李紅曦，臺中區農業改良場，彰化縣大村鄉。
4. 李長沛、吳佩真、吳東鴻*、賴明信、顏信沐，2022，水稻分子標誌輔助選育實務，精準育種農業科技之應用及發展，267-307頁，國立中興大學農業暨自然資源學院，台中市。
5. 吳東鴻、賴牧謙、劉祐廷、簡禎佑、李長沛、鄭佳綺、李誠紘、楊智哲、胡智傑、廖勁穎、陳繹年、賴明信，2022年，增進環境調適能力與友善環境生產之水稻品種培育研究，農園作物育種研究成果研討會專刊(農業試驗所特刊第237號)，28-52頁，行政院農業委員會農業試驗所、臺中。[2022年12月出版]
6. Dong-Hong Wu*, Pei-Jhen Wu, Chih-Yun Ting, Chin-Ying Yang, Jhih-Ming Chen, Yu-
Shiang Tung, and Ming-Hsin Lai. 2020. Intelligent agriculture in Taiwan: case study on alternative paddy irrigation management to cope with climate change. 2020 Videoconference on “Crop Resilience for Adaptation to Climate Change: Rice” pp. 57-68. Sep 29, FFTC and MARDI.
7. Charng-Pei Li, Chwen-Ming Yang, Dong-Hong Wu, Ming-Hsin Lai, Chih-Wei Tung, Mei-Ling Cheng, Bing-Jhih Liou, Hei Leung. 2020. Genetic resource evaluation and marker-assisted breeding for heat tolerance in rice in Taiwan. 2020 Videoconference on “Crop Resilience for Adaptation to Climate Change: Rice” pp. 103-114. Sep 29, FFTC and MARDI.
8. Charng-Pei Li, Ming-Hwei Yao, Wu-Huan Hsu, Chun-Tang Lu, Dong-Hong Wu, Ming-Hsin Lai, Chwen-Ming Yang. 2019. Precision agriculture in Taiwan: examples and experience. International Workshop on “ICTs for Precision Agriculture,” August 5-9, MARDI Headquarters, Selangor, Malaysia. P68-78。2019/8.
9. Wu, D.W., D. Gealy, Y. C. Wu, M. Jia, J. D. Edwards, M. H. Lai, and A. McClung. 2018. Insights into the biology, diversity, and origins of weedy red rice and the use of phylogeographical structures to control its seed-mediated contamination in Taiwan. p. 17-31. In: Shih, H.T. & C. J. Chang [eds.]. Proceedings of the 2018 International Symposium on Proactive Technologies for Enhancement of Integrated Pest Management of Key Crops. Taichung, Taiwan, 4-6 September 2018. Special Publication of TARI No. xxx, Council of Agiculture, Executive Yuan, Taiwan Agricultural Research Institute, Bureau of Animal and Plant Health Inspection and Quarantine.
10. 許健輝、林毓雯、莊愷瑋、吳東鴻、劉滄棽、郭鴻裕、李達源，2018，利用土壤管理降低稻穀鎘、鉛、砷累積之研究，107年度「農田土壤肥料乘載量及土壤管理」研討會論文集，64-70頁，國立中興大學、臺中。
11. 吳東鴻、杜沛蓉、吳佩真、許健輝、林毓雯、李長沛、賴明信，2018，水稻鎘元素調控基因之遺傳歧異性與低累積選育模式，「第十二屆海峽兩岸土壤肥料學術交流研討會」暨「土壤肥料推廣研發成果發表會及友善環境農業資材栽培管理研討會」論文集，97-98頁，中華土壤肥料學會、中國土壤學會、中華肥料協會、臺灣大學農業化學系，台北市。
12. 吳東鴻、杜沛蓉、吳佩真、許健輝、林毓雯、李長沛、賴明信，2018，以秈稉全染色體置換系族群探勘鎘累積能力之定位研究，「第十二屆海峽兩岸土壤肥料學術交流研討會」暨「土壤肥料推廣研發成果發表會及友善環境農業資材栽培管理研討會」論文集，113-114頁，中華土壤肥料學會、中國土壤學會、中華肥料協會、臺灣大學農業化學系，台北市。
13. 吳東鴻*、吳佩真、李長沛、許健輝、林毓雯，2018，應用水稻功能性基因體學技術輔助選育低鎘累積新品系之研究，「農業生產環境與作物重金屬安全管理研討會」論文集，43-54頁，農業試驗所、臺中。
14. 賴明信、吳東鴻*、李長沛、卓緯玄、顏信沐，2014，高產飼料稻米專用品
種之選育，「因應氣候變遷與糧食安全之農業創新研究」
102 年度成果發表暨研討會論文集，台中市。
(C)技術報告及其他等:
1. 劉宏澤、吳東鴻，2024，與自然同行的生態農業─以國合會駐巴布亞紐幾內亞技術團稻種增產計畫為例，國際援助開發現場季刊，17:39-48。
2. 吳東鴻、劉宏澤、李靖宇，2024，農業外交視窗-巴布亞紐幾內亞稻作產業發展與技術轉譯展望，技術服務季刊，139:11-21。
3. 吳東鴻、杜沛蓉，2024，昔日赤米大軍，重出江湖-臺灣雜草稻的起源與競爭優勢，農業世界，485:4-11。
4. 吳東鴻、吳佩真，2024，株裡行間的隱患-雜草稻的樣態與傳播，農業世界，485:12-18。
5. 吳東鴻、吳佩真、杜沛蓉，2024，因地制宜的管理方針-雜草稻的防治策略，農業世界，485:19-24。
6. 簡禎佑、吳東鴻，2023，美國農業部戴爾邦伯斯國家水稻研究中心及阿肯色州立大學水稻研究與推廣中心簡介及交流心得，桃園區農業專訊, 1-4。
7. 李長沛、吳東鴻、顏信沐、黃守宏，2022，香米家族新成員-抗核飛蝨早熟水稻新品種台農85號，技術服務 33(2):1-6。
8. 吳東鴻、賴牧謙，2022，網絡分析技術於農業基因體資料之應用-以水稻為例，技術服務 33(2):11-15。
9. 李長沛、林盟翰、陳繹年、吳東鴻，2022，水稻耐熱性檢定圃的設置與應用，技術服務 33(2):1-5。
10. 賴沐謙、吳東鴻、李長沛，2022，利用PlantGSAD資料庫平台對農業基因體資料基因群富集分析之簡介，技術服務 33(2):30-35。
11. 李長沛、夏奇鈮、何佳勳、陳榮坤、楊智哲、黃家興、胡志傑、吳東鴻、賴明信，2022，因應全球暖化之耐熱水稻育種策略，農業世界 467:59-69 。
12. 吳東鴻、賴牧謙、吳佩真、李長沛，2021，厚植精準育種基盤因應氣候變遷-以水稻抗逆境育種為例，農業世界 456:30-34。
13. 李長沛、顏信沐、吳東鴻、賴明信、黃守宏，2021，抗褐飛蝨早熟香米品種臺農85號之育成，農業世界 458:18-21。
14. 吳東鴻、王毓華，2021，水稻智慧間歇灌溉兼具智能省工與節水穩產，技術服務 126:30。
15. 吳東鴻，丁芝筠，2021，訪談稻農對紅米自生苗的認知介紹，農業世界，455:90-94。
16. 吳東鴻，吳佩眞，2021，用水大作戰氣候變遷下稻作產業用水變革起手式，農業世界，453:40-45。
17. 吳東鴻，2020，阻絕精品米的殺手：農業試驗所研發防除紅米的管理技術，技術服務，122:41。
18. 吳東鴻，2020，架構移植栽培下雜草型紅米入侵之綜合清除技術，國際農
業科技新知，
85:23-30。
19. 吳東鴻、吳佩真，2019，辨識黃穀雜色米混雜的好幫手-漂白水，農業世界 436:46-49。
20. 吳東鴻、吳佩真，2019，自交作物之保種與採種-以水稻為例，農業世界 427：6-10。
21. 吳東鴻、吳佩真，2019，採種田之建立與管理-以大宗作物水稻為例，農業世界 427：11-16。
22. 吳東鴻、陳昱蓉，2018，應用非酶切系統偵測單一核苷酸變異，技術服務季刋，115: 14-18。
23. 吳東鴻、吳佩真、李長沛、林毓雯、許健輝，2018，讓稻米從源頭開始隔「鎘」不入，豐年半月刊，68 (3):104-109。
24. 吳東鴻、戴乃強、鄭智允、吳以健、吳炳奇、李長沛、David R. Gealy，2017，捲土而來的雜草型紅米-從潛在起源至近年擴散狀況，磯小屋米報電子報第23期http://epaper.ntu.edu.tw/?p=view &listid=236。
25. 吳東鴻、戴乃強、黃守宏、李長沛，2017，台灣水稻飛蝨類害蟲為害與抗蟲育種契機，技術服務季刊，112: 15-20。
26. 吳東鴻、鄭智允、吳以健、吳炳奇，2017，台灣雜草型稻的北部地區形態介紹與可能起源，農業世界雜誌，407:15-21。
27. 吳東鴻、林庭萱，2017，稻田新興雜草-雜草型紅米危害特性與防治，農業世界雜誌 403: 403:18-23。
28. 卓緯玄、李長沛、賴明信、顏信沐、吳東鴻，2016，彩葉稻(Coleusrice)的大地渲染，技術服務季刋，110:1-5。
29. 吳東鴻，2016，以全基因組關聯性分析(GWAS)策略提升育種親本與重要基因座探勘效率，技術服務，107:17-21。
30. 王毓華、溫英杰、李長沛、吳東鴻、楊嘉凌、羅正宗、黃佳興、賴明信、廖大經、陳榮坤、陳裕儒、林訓仕、吳昭慧、陳玉如、何政坤、劉千如、張勝智。2016。因應氣候變遷農業資源調適對策-農作物抗逆境品種研發。農政與農情285:28-33
31. 卓緯玄、陳昱蓉、賴明信、李長沛、顏信沐、吳東鴻*，2016，翻轉抗病育種的新思維--以分子輔助選育稻熱病抗性為例，農業世界，394:34-38。
32. 吳東鴻、吳佩真，2016，世界水稻科技重鎮-國際水稻研究所與其研究方向，農業世界 390:102-108。
33. 吳東鴻、李家欣，2016，馬來西亞稻作產業與品種變遷之介紹，技術服務 105:30-34。
34. 卓緯玄、李長沛、賴明信、顏信沐、吳東鴻，2015，水稻品種權申請的對照品種選定方法，技術服務 26:1-6。
35. 吳東鴻、戴宏宇、溫英杰，2014，國際交流心得-巴西大豆產業與研究介紹，技術服務 100: 27-30。
36. 吳東鴻、溫英杰，2014，巴西稻作產業與育種程序介紹，技術服務 99: 30-33。
37. 吳東鴻、林孟誼、卓緯玄、李長沛、顏信沐、賴明信，2014，多元化調整抽穗期以穩定稻作生產結構，技術服務 99: 1-6。
38. 陳純葳、吳東鴻、楊嘉凌、張素貞，2014，國際稻米研究所水稻白葉枯病抗性檢定評估技術研習心得報告，技術服務 97: 19-23。
品種命名或品種權：
1. 李長沛、賴明信、曾清山、顏信沐、卓緯玄、吳東鴻、陳治官、曾東海，2011命名，水稻台農77號，於2011年6月15日舉辦公開說明會，該新品種具有早熟、米質優良等特性，已供全國14個地區20個以上的農民試種，於2015年4月23日取得品種權，品種權字第A013583號 (2015-2035年)。
2. 卓緯玄、李長沛、賴明信、顏信沐、吳東鴻、曾東海，2012，水稻台農79號，於2012年6月14日取得品種權，具有中晚熟、豐產、米質優良等特性，品種權字第A01263號 (2012-2032年)。
技術移轉：
1. 【技術移轉】水稻生產智能化灌溉程式模組，113年09月-118年8月，發明人為吳東鴻、賴明信、卓緯玄等3人，非專屬授權5年，授權廠商是「仲闐科技股份有限公司」，授權金40萬，個人貢獻80%。
2. 【技術移轉】彩稻組合稻種使用權，103年03月-108年12月，發明人為李長沛、卓緯玄、吳東鴻等5人，非專屬授權1-3年，授權廠商是「答樂歌部落產業發展協會」、「屏東縣政府」、「草屯鎮北投國小」、「芳榮米廠」、「力譔堂整合行銷公司」、「苗栗縣苑裡鎮農會」、「花蓮縣玉里鎮農會」、「台灣稻農有限公司」、「斗南鎮農會」，累計9件授權金87萬，個人貢獻12%。
2019，「彩稻組合稻種使用權」，非專屬授權，授權廠商：食米文化公司(農試技字第1082143586號、0612)、沃畝股份有限公司(農試所字第1082153218號、0318)、部落廚房企業社(農試所字第1082153213號，0221)、斗南鎮農會、台灣稻農有限公司、玉里鎮公所、玉里鎮公所。貢獻12%。
3. 【技術移轉】水稻台農77號品種權，105年06月-108年12月，發明人為賴明信、李長沛、吳東鴻等5人，非專屬授權3年，授權廠商是「草屯鎮農會」、「富里鄉農會」，授權金50萬，個人貢獻15%。
4. 【技術移轉】水稻台農79號品種權，105年12月-110年12月，發明人為賴明信、卓緯玄、吳東鴻等12人，非專屬授權5年，授權廠商是「統一超商股份有限公司」，授權金180萬，個人貢獻10%。
5. 【技術移轉】台灣水稻品種鑑定SSR分子標誌系統，104年4月-107年4月。發明人為胡凱康、柯宇珊、吳東鴻等12人，非專屬授權3年，授權廠商是「昕穎生醫公司」、「台灣檢驗科技(SGS)公司」，共2件授權金累計68萬，個人貢獻5%。
6. 【技術移轉】狼尾草台畜草二號品種境外授權及栽培技術，97年-107年，發
明人為成游貴、許福星、陳嘉昇、施意敏、吳東鴻等
32人，專屬授權10年，授權廠商是「台灣能源公司」，授權金460萬，個人貢獻1%。
研究計畫
臺灣雜草稻種子壽命遺傳調控因子之研究(114-2313-B-005-051-MY3)，國科會，2025/08/01~2028/07/31，主持人。
氣候變遷下乾旱對濁水溪流域之產業、環境與社會風險評估－氣候變遷下旱災對農業之衝擊與適應策略(子計畫三)(2/2)(114-2625-M-032-003-)，國科會，2025/08/01~2026/07/31，共同主持人。
氣候變遷下乾旱對濁水溪流域之產業、環境與社會風險評估－氣候變遷下旱災對農業之衝擊與適應策略(子計畫三)(1/2)(113-2625-M-141-001-)，國科會，2024/08/01~2025/07/31，共同主持人。
臺灣雜草稻種子壽命優勢適應機制與育種應用(111-2313-B-055-001-MY3)，國科會，2022/08/01~2025/07/31，主持人。
解析臺灣雜草型紅米種子休眠性與老化之功能基因體網絡(3/3)(110-2628-B-055-001-)，國科會，2021/08/01~2022/07/31，主持人。
利用智慧科技解析Bph31(t)抗褐飛蝨機制、監測蟲害、育成多元抗蟲水稻品種及有機產業應用－利用智慧科技解析Bph31(t)抗褐飛蝨機制、監測蟲害、育成多元抗蟲水稻品種及有機產業應用(110-2321-B-005-011-)，國科會，2021/07/01~2022/06/30，共同主持人。
114年，中部地區小尺度最適灌溉模式優化與指引建立，農業部農業試驗所，共同主持人。
114年，建立因應氣候變遷之水稻育種平台與應用 (1/4)，農業部農業試驗所，共同主持人。
114年，稻作數位育種平臺開發與決策模式驗證之研究，農業部高雄區農業改良場，共同主持人。
113年，中部地區小尺度最適灌溉模式優化與指引建立，農業部農業試驗所，共同主持人。
113年，提升直播稻幼苗生長勢之研究，農業部農業試驗所，主持人。
113年，免耕技術應用於旱田直播水稻玉米輪作制度研究，農業部農業試驗所，共同主持人。
112年，免耕敷蓋技術應用於直播水稻玉米輪作制度研究，農業部農業試驗所，共同主持人。
112年，水稻間歇灌溉生育期用水量研究，農業部農業試驗所，主持人。
112年，提升水稻幼苗生長勢之選育研究，農業部農業試驗所，主持人。
111年，水稻鎘吸收遺傳歧異性與低累積選育模式建立之研究(2/2)，農委會農業試驗所，主持人。
111年，水稻間歇灌溉生育期用水量研究，農委會農業試驗所，主持人。
111年，結合資通訊水稻水分與肥培管理模式遙感監測技術驗證(2/2)，農委會農業試驗所，主持人。
111年，水稻生育後期高溫逆境適應性育種，農委會農業試驗所，共同主持人。

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